L’hépatite E est une maladie causée par un virus à ARN de répartition mondiale et géographiquement très hétérogène. La transmission se fait essentiellement par voie oro-fécale, causant une infection généralement asymptomatique. Toutefois, elle peut devenir sévère avec des taux de mortalité très élevés dans certains groupes de population, notamment les femmes enceintes et les personnes immunodéprimées. Au-delà des enjeux sanitaires, économiques et environnementaux, la problématique de l’hépatite E en Afrique de l’Ouest est peu couverte comme en témoigne le nombre très limité d’études scientifiques. D’un point de vue stratégique, l’obtention de nouvelles données épidémiologiques s’avère nécessaire et permettra de combler ce gap. Dans le cadre de la JEAI EPIVHE, le GRBA-BE et l’UMI233 de l’IRD ainsi que leurs collaborateurs, ont développé ce projet, dont l’objectif principal est de déterminer la prévalence de l’hépatite E et les facteurs socioculturels et environnementaux associés à l’exposition au VHE dans les régions de Dakar, Kédougou, Saint-Louis et Ziguinchor. Cette recherche est actuellement en cours d’exécution auprès des femmes enceintes venues en consultation prénatale. La deuxième phase se focalisera sur la recherche du VHE dans les denrées alimentaires à forte consommation. Il s’agira d’une part des produits carnées de la faune domestique (Porc, lapin, poulet, crustacés) et d’autres part les eaux en sachet plastiques, les fruits et légumes (fraises, salades et tomates) vendus dans les marchés et étales. À terme, les résultats obtenus permettront de documenter la prévalence du virus de l’hépatite E chez les femmes enceintes et dans les denrées alimentaire ; le tout pour formuler des recommandations dans le but d’améliorer la prise en charge, la sécurité sanitaire des aliments et les stratégies nationales de prévention et de surveillance.
Cette recherche s’inscrit dans la continuité de nos travaux (Diouara, Ndiaye et al. 2014, Edmond, Diouara et al. 2014, Diouara et al. 2018). Nous avons amorcé l’étude de la distribution et de l’évolution des sous-types du VIH-1 en Afrique sur la période allant de 1990 à 2014. Les résultats préliminaires observés corroborent la distribution classique des sous-types du VIH-1, qui montre une prédominance spécifique de sous-types selon les régions géographiques. Cependant, des variations significatives des proportions des sous-types de certains sous-types (tels que le sous-type A et le CRF02_AG) ont été observées dans les régions de l’Afrique de l’ouest et du centre. Ce travail préliminaire a également permis de mettre en en évidence une propagation continue de virus recombinants avec des proportions notables d'URF en Afrique de l’ouest, du centre et du nord. Ce projet vise à fournir une carte complète de l’évolution et de la dynamique de la diversité génétique des souches virales y compris du paysage mutationnel depuis l’introduction de la thérapie antirétrovirale au Sénégal. De façon spécifique et pour une meilleure compréhension de la dynamique des principaux sous-types viraux et de l'épidémiologie moléculaire actuelle du VIH-1, des études phylogénétiques et phylogéographiques à grande échelle sont envisagées.
Ce projet vise la mise au point d’un prototype de système de monitoring en temps réel d’une Biobanque (Sample CAST®). De manière spécifique, il permettra : 1. La collecte de données et d'identification et de ré-identification directe de l'échantillon : • Lors du transport, le stockage et de la conservation (primaire, secondaire voire tertiaires) des échantillons, • Le traçage de l'historique des traitement (analyses de routines) opérés sur l'échantillon. 2. le développement d'une application dédiée au prototype Sample Cast® permettant de relier la base de données, l’outil Sample CAST® y compris d’un lecteur de code à barre.
La pandémie de COVID-19 a bouleversé les activités académiques au Sénégal comme dans la plupart des autres pays dans le monde. Après la première vague de la pandémie et la fermeture des campus, les enseignements et apprentissages ont repris en présentiel dans les universités Sénégalaises. Depuis, des milliers d’étudiants se sont réinstallés. Les autorités académiques ont pris des mesures sanitaires pour prévenir la maladie et déterminer les conditions de prise en charge de cas éventuels. Par ailleurs, l’absence de traitement spécifique, la couverture vaccinale encore faible et l’émergence de nouveaux variants justifient le renforcement et le déploiement de nouvelles stratégies de prévention et de surveillance de la COVID-19. C’est dans ce sens, que nous proposons cette recherche visant à évaluer le niveau de perception et d’appropriation des mesures barrières par la communauté universitaire. Il sera également question de rechercher les coronavirus sur les surfaces de contact à haut risque et dans le réseau d’eaux usées de l’UCAD. La finalité de ce projet est de mettre en place d’un système de surveillance environnementale de la COVID-19 et contribuer ainsi à endiguer la propagation du virus.
PFE : Abdou DIONGUE - Soutenu : 01/08/2019 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Industries Alimentaires.
PFE : Ndèye Maguette DIOP - Soutenu : 14/12/2020 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Technologue - Option : Industries Alimentaires.
PFE : Awa Marcelle Sall - Soutenu : (en cours) - Grade : Master d’Informatique, Modélisation et Simulation des Systèmes Complexes (IMSSC) et Modélisation et traitement de l’information (MTI).
PFE : Ndéye Saly DIENG - Soutenu : 17/01/2019 - Grade : Master Hygiène – Qualité – Sécurité – Environnement
PFE : Sarbanding SANE et Sophie D TENE - Soutenu : 23/12/2021 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
Seynabou COUNDOUL GADJI - Soutenu : 23/12/2021 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
PFE : Mame Yacine Fall - Soutenu : 27/01/2023 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
Betty Kane - Soutenu : 27/01/2023 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
PFE : Mohamed Traoré - Soutenu : 27/01/2023 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
PFE : Yaye Fatou THIAO - Soutenu : 23/06/2022 - Grade : Diplôme d’Ingénieur de Conception - Option : Génie Biologique et Biotechnologies.
Résumé : Ce projet vise le développement et la mise en œuvre d'une plateforme de prestation de services en ligne qui se situera à l’interface des laboratoires d’analyses biomédicales et le patient. HomeLab a pour objectifs: (i) de limiter les déplacements des patients, surtout ceux en âge avancé, les enfants et ceux à mobilité réduite, (ii) de maximiser le nombre de tests réalisés par jour par les laboratoires d’analyses biomédicales avec un gain de temps dans l’enregistrement, l’orientation des patients, une baisse considérable de la consommation d’intrants nécessaires à la phase pré-analytique, tels que les aiguilles, les tubes et les seringues etc., (iii) d’offrir une opportunité d’emploi à des jeunes diplômés et professionnels au chômage. En collaboration avec les laboratoires, des infirmier(e)s et des technicien(ne)s en analyses biologiques, cette plateforme offrira aux patients la possibilité de se faire prélever au niveau de leurs domiciles ou lieux de travail et de recevoir leurs résultats dans les meilleurs délais, sans se déplacer. Un usager de la plateforme HomeLab, côté client, désireux de faire une analyse, n’aura qu’a consulter le site web conçu à cet effet ou entrer en contact direct avec le centre d’appel et d’enregistrement. Ainsi, sa requête sera prise en charge et orientée vers un service de laboratoire, et ce, tenant compte des paramètres comme le coût, le délai de rendu des résultats conformément à ses attentes. Une équipe mobile de techniciens ou d’infirmiers avec le matériel et les dispositifs de prélèvements requis, sera commise pour le prélèvement, sa conservation et son acheminement vers le laboratoire ciblé. Une fois disponibles, les résultats seront déposés directement au niveau de la plateforme sur le compte du client, et ce avec toutes les garanties sécuritaire et de respect de la confidentialité. Le client recevra une alerte SMS et/ou mail indiquant la disponibilité de ses résultats dans son compte personnel, préalablement crée à l’enregistrement de sa requête. Élèves ingénieurs DIC-G2B (2018-21) : Aminatou A. A. A. BAWA, Khoudia CISSE, Seynabou COUNDOUL, Pape Ibrahima FAYE, El Hadj Birane MBOUP, Sarbanding SANE, Sophie Deli TENE, Yaye Fatou THIAO - Superviseurs : Dr Malick DIOUARA et Dr Idy DIOP
Résumé : Ce projet vise le développement et l'installation de système de gestion de laboratoire (SIL). De manière spécifique, il s'agira de mettre en place : 1) Une base de données accessibles et opérationnelles, 2) Un système entièrement numérisé, 3) Une plateforme accessible à distance pour les collectes et l’extraction de données à des fins de recherche. 4) Mettre en place des collaborations dynamiques avec les institutions de recherches. Étudiante en master d’Informatique, Modélisation et Simulation des Systèmes Complexes (IMSSC) et Modélisation et traitement de l’information (MTI) : Awa Marcelle SALL Superviseurs : Dr Malick DIOUARA et Dr Idy DIOP